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jueves, 22 de septiembre de 2011

La biología sintética: Una levadura por todas las razones

Los científicos han comenzado a revisar el genoma de una levadura para que sea más estable, ingeniosa y capaces de evolucionar. Cabe destacar que la parte natural, parte sintética función de las células de levadura y se reproducen sin efectos nocivos evidentes.

Los recientes avances en la tecnología de síntesis del ADN han permitido la construcción de nuevos caminos genéticos y elementos genómicos, que amplian nuestra comprensión de los fenómenos a nivel de sistema. La capacidad de sintetizar grandes segmentos del ADN permite a la ingeniería de caminos y genomas según sistemas arbitrarios de principios de diseño. A continuación se describe un proyecto de levadura de genoma sintético, Sc2.0, y los cromosomas eucariotas primero parcialmente sintéticos, synIXR Saccharomyces cerevisiae cromosoma, y semi-synVIL. Hemos definido tres principios de diseño de un genoma sintético de la siguiente manera: en primer lugar, debe dar lugar a una (casi) de tipo salvaje y fenotipo físico, en segundo lugar, se debe la falta de elementos desestabilizadores como los genes tRNA o transposones 8 , 9 , y en tercer lugar, deben tener la flexibilidad para facilitar los estudios genéticos en el futuro. El genoma sintético ofrece varias modificaciones sistémicas cumplir con los principios de diseño, incluyendo un sistema de evolución inducible, revueltas (reordenamiento cromosoma sintético y la modificación de loxP mediada por la evolución). Se demuestra la utilidad de SCRAMBLE como un nuevo método de mutagénesis combinatoria, capaz de generar genotipos complejos y una gran variedad de fenotipos. Cuando se haya completado, el genoma sintético permitirá una reestructuración masiva del genoma de levadura, y puede abrir la puerta a un nuevo tipo de combinatoria genética basada enteramente en las variaciones en el contenido de genes y el número de copias.

jueves, 15 de septiembre de 2011

Variación genómica del ratón y su efecto sobre fenotipos y la regulación de genés


Relatamos las secuencias de genoma de 17 tensiones innatas de ratones de laboratorio e identificamos casi diez veces más variantes que antes conocido. Utilizamos estos genomas para explorar la historia filogenética del ratón de laboratorio y examinar las consecuencias funcionales de variación alelo específica sobre abundancia de transcripción, revelan que al menos el 12% de transcripciones demuestran un sesgo significativo de tejidos específicos de expresión. Identificando variantes funcionales del candidato en 718 lugares geométricos cuantitativos del rasgo, demostramos que la naturaleza molecular de variantes funcionales y sus genes en relación con la posición varían según el tamaño del efecto del lugar geométrico. Estas secuencias proporcionan un punto de partida para una nueva era en el análisis funcional de un organismo modelo clave.

 
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